根据每班的课程教学计划、合作办班单位的意见、学员的实际情况，在职研究生课程进修班的课程教学组织方式是多种多样的。
有的在职研究生班则是利用每周六和周日全天时间，有的是两周一次，利用周五晚上及周六、周日时间安排课程教学;有的班是利用寒暑假的时间;有的班每隔一段时间集中若干天授课(主要是异地办的班);有的班既利用假日又占用一定的工作日。但一个班只有一种方式。学员可以根据自己的工作性质进行选择。
总得来说在职研究生的教学方法是理论与实践相结合、课堂讲授与自学相结合。发给学员讲授大纲或教材;规定必读及参考书目，以利于自学;有的课程还要求撰写课程论文。
